商铺只有40年的使用权的原因是因为在中国的土地制度中，土地所有权归国家所有，个人或企业只能通过土地使用权来使用土地。根据国家法律规定，商铺的土地使用权通常为40年，这是基于国家经济发展和土地资源管理的需要。

首先，40年的使用权是为了平衡土地资源的供需关系。中国是世界上人口最多的国家之一，土地资源有限，因此需要通过限制土地使用权的期限来控制土地的使用和开发。40年的使用权期限可以确保土地能够更有效地流转和利用，避免土地被个人或企业长期占用而无法合理利用。

其次，40年的使用权也是为了鼓励经济发展和投资。商铺作为商业用地，通常需要巨额的投资和长期的经营才能获得回报。较长的使用权期限可以为投资者提供相对稳定和可预测的经营环境，鼓励他们进行商业活动和经济发展。

另外，40年的使用权也可以促进土地的合理利用和更新。通过设定较短的使用权期限，可以迫使土地使用者在期限到期前进行土地的开发和利用，避免土地闲置或低效利用。同时，土地使用权期限到期后，土地可以重新流转，更好地满足社会和经济的需求。

需要注意的是，商铺的使用权到期后，并不意味着土地上建筑物的归属权也会消失。建筑物的所有权通常是独立于土地使用权的，可以通过租赁、转让等方式进行管理和变更。

总的来说，商铺只有40年的使用权是基于土地资源管理和经济发展的需要，旨在平衡土地供需关系、鼓励经济投资和促进土地的合理利用。这一制度有助于保障公共利益和经济可持续发展。